Insieme alla forza militare andava intanto sempre più consolidandosi la vocazione mercantile, che avrebbe portato Pisa ad affermarsi come una delle grandi potenze dell’area mediterranea: costituitasi in libero comune, dopo il Mille affermò il suo dominio sulla Sardegna, sulla Corsica e sulle Baleari; sull’onda delle Crociate riuscì a estendere il suo influsso commerciale fino alla Siria.
Il periodo aureo va dal XII° secolo alla prima metà del XIII°: l’arco temporale in cui Pisa si consegna alla storia come gloriosa Repubblica Marinara, si arricchisce di monumenti splendidi e vede nascere lo Studium universitario, uno dei più antichi e prestigiosi d’Europa.